The art of genome assembly and the Staden Package
By Giuseppe D'Auria, Ph.D. PI, Bioinformatician FISABIO Sequencing and Bioinformatics Service, Valencia, Spain About me: https://orcid.org/0000-0001-6292-2420 @gidauria I finally find [...]
Seqüenciant SARS-CoV-2
Per: l'Equip del Servei de Seqüenciació i Bioinformatica de FISABIO Loreto Ferrús @loretoferrus, Inma Galán Vendrell @Immagalan5, Griselda De Marco [...]
I per fi arribem a Linux
Per Giuseppe D'Auria, Ph.D. IP, Bioinformática Servei de Seqüenciació i Bioinformàtica de FISABIO, València (Espanya) Sobre mi: https://orcid.org/0000-0001-6292-2420 @gidauria Hui [...]
En els últims 10 anys la seqüenciació de DNA ha experimentat un creixement exponencial a causa de l’aparició i desenvolupament de les tècniques de seqüenciació massiva (en anglés NGS, Next Generation Sequencing). Actualment aquestes sigles engloben tant les plataformes de seqüenciació de segona generació com les noves plataformes de tercera generació. La implementació i el desenvolupament d’aquestes tècniques obri noves possibilitats d’anàlisis en múltiples subdisciplines relacionades amb les Ciències Biològiques i de la Salut.
Perquè aquests avanços es produïsquen resulta indispensable disposar tant de plataformes de seqüenciació adequades com de personal experimentat en aquesta mena de tècniques.
En aquest context i amb la finalitat de promoure la investigació biomèdica, naix el Servei de Seqüenciació i Bioinformàtica de FISABIO-Salut Pública.
Serveis
Protocols de seqüenciació
Ofereix la possibilitat de multiplexar segons la cobertura requerida per l’usuari: seqüenciació de transcriptomes, de genomes eucariotes, procariotes i virus complets, de amplicons, metagenòmica/metatranscriptòmica, xicotets RNA, panells de gens, etc.
Anàlisi bioinformàtica
El Servei aplica fluxos de treball estandarditzats (pipelines) preestablits. En cas de necessitat, existeix la possibilitat d’elaborar pipelines ad hoc en funció de les necessitats de l’usuari.
Assessoria
FISABIO posa a la disposició dels usuaris l’experiència adquirida en la seua trajectòria: des dels primers seqüenciadors de segona generació, passant per l’evolució dels seqüenciadors d’Illumina fins a les noves tecnologies de tercera generació.